Коричневые карлики имеют очень неспокойные атмосферы, похожие на атмосферу газовых гигантов, в частности, Юпитера. Наблюдения с помощью орбитального телескопа Спитцер показали, что атмосферы коричневых карликов практически постоянно страдают от штормов. Среди 44 наблюдавшихся в течение 20 часов карликов около половины показали колебания яркости. Эти колебания могут быть вызваны практически только штормами, а так как как раз половина должна быть ориентирована так, что либо шторма не видно, либо они за время наблюдения не меняются, то выходит, что большая часть коричневых карликов подвергается действию штормов. Эти штормы длятся в течение как минимум нескольких часов, охватывая области, превышающие площадь земной поверхности. Существуют ли на коричневых карликах устойчивые штормы, существующие годами, как Большое красное пятно Юпитера, неизвестно. Содержание облаков в штормах – не водяное. Слишком высокие температура и давление скорее вынудят выпадать дождь из расплавленного камня и металла.